Nature Communications：T细胞基因组的三维结构能调节自身免疫吗？
（关于SATB1多种作用方式及其失调可能导致疾病的建议模型。图2中引入的SATB1的不同变体可以定义位于细胞核内的相当多样的相互作用组。因此，不同的SATB1变体将不同的染色质修饰或重塑复合物募集到受调控的基因上。染色质可及性被修饰并且发生转录激活或抑制。此外，SATB1介导远程启动子-增强子通讯并最终调节染色质组织。在其不存在的情况下，基因组的相互作用组和/或环状结构被改变，导致修饰的转录组。在这里，我们演示了两个不同的SATB1变体如何正向或负向控制两个基因的转录。这种转录状态在Satb1敲除小鼠中失调，最终导致诸如自身免疫的疾病。尚未彻底研究人类自身免疫性疾病中SATB1蛋白失控与染色质景观改变和/或基因组组织改变之间的联系。）
福斯分子生物学和生物技术研究所副教授Charalampos G.Spilianakis的研究小组一直致力于确定T细胞基因组的三维组织是否可以调节自身免疫。
研究小组创造了一种T细胞特异性基因敲除小鼠，该小鼠缺失了SATB1基因。DNA在我们的细胞中并不是裸露的，而是与大量的蛋白质相互作用，这些蛋白质包装并调节DNA，以适应真核细胞的细胞核。
SATB1蛋白与染色质结合并调节T淋巴细胞基因组的三维结构。该小鼠模型通过皮毛和皮肤问题、多种组织和淋巴器官（胸腺和脾脏）的炎症表现出广泛的自身免疫。
利用大量的基因组方法，参与的科学家能够证明SATB1蛋白本质上在T淋巴细胞的三维空间中创建基因网络，并且它们的表达被极其精确地调节。
上述蛋白质（T淋巴细胞染色质的组织者）的缺乏导致免疫特异性基因的表达失调，并因此导致广泛炎症和自身免疫的诱导。
该研究团队的下一步是在自身免疫研究领域，包括设计高度特异性的小分子，以测试其抑制炎症和自身免疫的能力，最初在小鼠模型中进行，随后在人类中进行。
该数据已发表在《自然通讯》（Nature Communications）上。
The 3D enhancer network of the developing T cell genome is shaped by SATB1, Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-34345-y
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